沈阳第六人民医院是国家级中医药防治传染病重点研究室；中医肝病科被评为“十一五”“十二五”国家重点专科；传染科是辽宁省临床重点专科；中医传染病科是辽宁省“十三五”中医重点专科；肝炎专业、动物源性传染病专业是沈阳市临床重点专科, 2017年被市科技局评为沈阳市肝胆疾病临床医学研究中心。现为辽宁省免疫学会感染免疫专科分会、辽宁省中西医结合学会传染病专业委员会主任委员单位，医院拥有院士工作站一个，是国家认证药物临床试验基地，全国健康促进与教育优秀实践基地创建单位。2017年成为沈阳市首批DRGS试点单位。
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